五十年后的未来，世界遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。人类文明的武器无法与荒神抗衡，生化科技企业“芬里尔”利用荒神细胞开发出了名为“神机手”的...
为了打倒荒神而成为噬神者的少年空木莲华，成为了新型适合者，莲华在测试训练中的优秀表现令雨宫三佐侧目，但莲华总是为了救他人而将自己置于危险之中，这点...
面对荒神和伐折罗的双重袭击，雨宫同意莲华加入作战。莲华和佐久夜将艾瑞克送到安全地带，随后两人突袭伐折罗。然而计划失败，莲华被伐折罗所释放的电流击昏...
这次莲华等人的任务是救援拥有新型神机的艾莉莎，但被荒神围困在运输机上的艾莉莎却拒绝接受救援，莲华等人只能在直升飞机上进行支援。进化的荒神引来了同伴...
被荒废了的近未来，突然出现开始蚕食世界的巨大生物“荒神”。为了消灭所有荒神而来到芬里尔极东分部的少年空木莲华，以及围绕在他身边的荒神讨伐部队的噬神者...
为了神盾计划，新型噬神者亚莉莎·伊莉妮提娜·阿米耶拉来到机东分部。她与莲华、浩太被分配到第一部队，由队长龙胆、副队长佐久夜和索玛带领。神盾计划是要将...
指定核心的收取已经确认，任务终于完成。莲华似乎有心事，他在解散前叫住了龙胆，欲言又止的他最终没有说出内心的想法。之后，莲华单独去询问云雀小姐关于神...
醒来的莲华看到了还在昏迷中的亚莉莎，简单的处理后亚莉莎恢复了生命迹象。打败他们的黑色的伐折罗让亚莉莎非常介意，在她准备起身去寻回神机时身受重伤的莲...
现在的情形让龙胆等人无法顺利前往救助站，获救的莲华和亚莉莎跟着龙胆一起来到了一个村子，村子里都是无法前往极东避难的人们，而一直默默支撑这个村子的正...